大型免許取得おめでとうございます。
1番 質問者さんの用途に一番適しているのはNC750Xだと思います。
通勤時の燃費の良さはピカイチです。
そして高速巡航も、小さいながらカウルが付いている恩恵は大きいです。
ハンドリングも良好、チョイ乗りも遠出も得意な車両です。
足着きは問題ないでしょうし、車重も程々で普段使いに支障無しです。
低回転型のエンジンフィーリングが嫌いな場合は慎重に検討必要です。
それとネットではNC嫌いな人を多く見かけるので、ねたみ交じりの 辛辣な意見を耳にすることもあるかもしれません。
2番 Ninja650が帰省にも通勤にもGoodだと思います。
カウルが付いて高速巡航が楽です。
こけたらカウルの修理代はかさみますが、こける前提で バイク通勤をするわけではないと思います。
3番 MT-07 軽快でバランスの良いバイクだと聞きました。
どちらかと言うとワインディングなどで軽快感を楽しむ事が 目的のバイクのようです。
車体の軽さやエンジンの特性的に、通勤にも使いやすいと思います。
4番 MT-09 インプレッション動画を見たところ、軽快な車体に豪快な パワーフィールのエンジンを持つ、趣味性の強いバイクのようです。
パワーの立ち上がりも明確に感じられ、パワーバンドに入ると1速 2速ではフロントアップしていました。
ピーキーと言うほどではないようですが、フラットではない エンジン特性を持っているようです。
もちろん通勤に使いづらいようなことは無いと思いますが 通勤に向いているバイクではありません。
走りを楽しむ事が目的ならば、この4車では逆に1番のお勧めです。
その他でお勧めのバイクですが、用途(通勤と帰省)から選ぶなら 私もNC750Xを選びます。
私自身、以前NC700Xを買おうかと検討したこともありました。
(通勤及び仕事の足として) 通勤にも使うけどドラマティックな走りも楽しみたい! と、欲張るならば程度のよい中古でNinja1000とか。
割高感がありますがCBR650Fもとてもいいバイクだと思います。
モデルチェンジで600から650になったのですが、ボアアップ ではなくストロークアップしているので、もともと良かった エンジンがさらに良くなっているはずです。
通勤、帰省、ツーリング、スポーツ走行、全てにGoodです。
そして分かる人にはかなりの「ツウ」だな、と見られるでしょう。
私の信条としては、多少不便でも好きなバイク、ビビビっときた バイクを買うのがよろしいかと考えます。