父の残したカワサキマッハIII500ssを修理しようと思うのですが、サイドカバーのタンクの中には

匿名さん

父の残したカワサキマッハIII500ssを修理しようと思うのですが、サイドカバーのタンクの中にはどのオイルを入れたら良いのでしょうか？2ストのエンジンオイルと同じものを入れれば良いのでしょうか？

2ストオイルはホンダやヤマハから出てるオートバイのオイルでOK。
サイドカバーのタンクは予備ではなく、まさにそのタンク内のオイルを使って潤滑しているので、エンジンをかければ減ります。
空にしてはいけません。
…というか、質問内容から推測するに、「ミッションオイル」に2ストオイルを使用してませんか？ もしそうなら、それはミッションを潤滑するためだけのオイルなので、専用のオイルを入れましょう。
ホームセンターやバイク用品店で「ミッション(ギア)オイル」で購入可能。
もしかして2ストバイクは初めてですか？ もしそうなら、ここで一つずつ相談するよりもバイク屋さんで正直に説明して面倒を見て貰いつつ、勉強した方が良いですよ。