詳しくはありませんが、基本は R3 で、それを日本向けにアレンジしたものが R25 ではないですかね。
現在の 125cc や 250cc と言う排気量は、1L を基本にした 1/2(500cc)、1/4(250cc)、1/8(125cc) と言う考え方によるものですよね。
しかし、世界的には 250cc に制度の境界がある国はほぼなく、最近は 150cc,300cc,600cc と言うクラス分けが多くなっているように思います。
特に、スポーツ走行を意識するバイクの主要な市場は欧州で、そこには125ccにしか制度の境界がありません。
バイクの売れない日本向けにわざわざ 250cc で専用設計をする理由は無く、基本的に R3 として設計し、エンジンのみ 250cc へ排気量ダウンしたものを R25 として日本向けにする、と言う形ではないか、であれば、重量なども含め最適設計がされているであろう R3 に比べ、R25 はどこかに無駄な部分があり、総合性能はその分劣るのではないか、と思いますね。
「自動二輪で運転出来ますか?」が運転免許の話なら、R25もR3 もどちらも排気量400cc以下ですので、普通二輪免許で運転できます。