車のエンジンがかからなくなり困っています

匿名さん

車のエンジンがかからなくなり困っています。
車はギャランフォルティス、スマートキーです。
先日、ナビ、ETC、サブウーハ―を外しました。
その後、バッテリーを つなぐとインフォメーション画面に「キー抜き忘れ」と 表示されイグニションが回せなくなり、鍵をぬいてシリンダーに差し、回すとONまではいくのですがセルは回りません。
またドアロックが助手席だけ効かず、鍵をドアに差してロック、アンロックしても助手席だけ効きません。
この車にはあと付けのVIPERセキュリティーがついていますが、こちらのリモコンとスマートキーでロック、アンロックすると共に後席のみ動作し、キーをドアに差してドアロック後(助手席は手動でロック）、VIPERをONさせた後、VIPERでアンロックするとVIPERだけ解除され、全席鍵が開きません。
長文ですみませんがどこがおかしいか教えて下さい。
よろしくお願いします。
パワーウインドウ、ヘッドライトなどは問題なさそうです。
ヒューズも問題なさそうです。

推定ですが バッテリー上り イモビライザー認識初期化 セキュリティ認識初期化 などはどうでしょうか