スーパーカブ50のタイヤ交換ってバイク屋に頼むのと自分で治すのってどれくらいの値段の差がありますか？原付を店まで運べないってなったらさらにお金かかりますか？

自分でやるのなら、タイヤは前後ともそれぞれ２０００円以下位です。
ホームセンターやamazonなどで手に入ります。
中のチューブも交換するなら、チューブは普通のチューブで８００円ちょいです。
あとはタイヤ交換が自分で出来る知識があれば、交換自体は比較的簡単な作業です。
エアーコンプレッサーが無くても、手動や足踏み式の空気入れで十分ですしね。
お店に頼むと、多分タイヤ代が３５００～４０００円、タイヤチューブは１０００円位。
そして交換工賃が前３０００円位、後４０００円位でしょうか。
後輪は外す部品が多い事や、作業の手間が掛かることで、標準作業時間が多くなるためです。
原付をお店まで運べないのなら、一番良いのは車輪を外してお店にもって行き、タイヤ交換してもらうことでしょう。
それなら、工賃が結構安くなりますよ、車体からの取り外しと取り付けの工賃が掛からないから。
交換してもらったら、持ってかえって取り付ければ完成です。
もしも、自分で車輪を外せない時には、お店に来てもらうことになりますが、来てくれるところと来てくれない所があります。
また、来てくれる場合でも、基本的にお店へトラックで運んでの交換作業になります。
この場合は、出張引き上げ料金が掛かります。
高額な事が多いですので、想像以上でびっくりするかもしれませんよ。
その場合は事前に引き上げ料金がいくらになるかも電話で聞いておいて下さいね。
ご参考までに。